有一天回到家裡，竟坐了一個人自稱是外星人？說著說著，電視上竟報起有不明物體墬落的快報…不會吧…他拼命想證明自己是外星人…

【vol.1】
葉 a leaf
在森林之中的小鳥 tiny wings in the forest
唱歌少女 the singing waif
鳥籠 the cage
迷宮 a maze
貓 the cat
收音機 a radio
踪跡 a trace
情債 a debt
花 a flower
會議 parliament
苜蓿草 clover
電話 a telephone
飛翔於夜空之中的有翼之魚 winged fish that flies through the night
豹 a leopard
傷痕 the scar
歌 a song
不應該存在之物 nonexistent
互道晚安 goodnight
追踪 pursuit
翅膀 feathers
【vol.2】
翅膀 feathers
遭受干擾的追踪 white-out
雖然相同，卻又有些不同 the one and not the same
夜 night
有關於我的事 about me
記憶 memory
移動裝置 the vehicle
想要到達的目的地 the destination
妖精遊樂園 the fairy park
三片葉 trefoil
心情 mind
天馬 pegasus
影畫 shadow-play
殺意 homicidal intent
最後的 the one last
改變呀 change
然後呢 and then
心 heart
葉 the leaf
【vol.3】
夢之中的妖精之夢 fairie's dream in a dream
織葉 oruha
在後台的小鳥之巢 bird's nest backstage
在籠中的小鳥之巢 bird's nest in a gilded cage
再會之花 flower of reunion
蟲之眼 bug-eye
一個人 alone
二個人 two
我能聽見 I can hear
開始之時 is beginning
沒有人知道的二重唱 duet no-one knows
魚之眼 fish-eye
謊 deceit
小鳥打給小鳥她的電話— phone from bird to bird
被送來給小鳥的小鳥 bird given to bird
接觸 contact
貓之眼 cat's eye
約定 promise
舞台 stage
小鳥的悄悄話 bird's secret conversation
雨 rain
只為了特定的一個人所唱的歌 song sung just for one
鳥之眼 bird's eye
小鳥心中的小鳥 bird in the heart of bird
第一次的會面 how do you do?
小鳥和小鳥創造的歌 song that bird and bird make
小鳥她們的秘密之歌 bird's secret song
只有小鳥們才知道的二重唱 duet only bird knows
永恆的一夜 night that does not go
小鳥和小鳥的秘密 secret between bird and bird
CLOVER clover
人之眼 man's eye
小鳥的淚 bird's tear
為了已經永遠消失的小鳥之小鳥 bird for bird gone
小鳥所創造的小鳥 bird that bird made
【vol.4】
有著四片葉的苜蓿草 FOUR-LEAF CLOVER
有著三片葉的苜蓿草 THREE-LEAF CLOVER
歌唱聲 SINGING VOICE
聽見的聲音 HEARD VOICE
呼喚聲 CALLING SOUND
通訊 COMMUNICATION
約定 A PROMISE
血 BLOOD
一人 ALONE
被放逐的人 THE HUNTED
追逐者 THE HUNTER
線 LINE
反應 REACTION
蜘蛛之巢 SPIDER WEB
守護者小鳥的歌 SONG TO WATCH OVER BIRD
回歸之處 A PLACE TO RETURN TO
雨 RAIN
5 FIVE
4 FOUR
3 THREE
信賴 CONFIDENCE
任務 MISSION
印 A SEAL
願望 A WISH
對苜蓿草而言的幸福是 BLISS OF CLOVER
髮與情話 HAIR AND CARESSES
鏡與接觸 MIRRORS AND TOUCH
好焦躁 IRRITATION
因為不知道所以非常想知道 WANT TO SEE BECAUSE I SEE NOT
為每個人而唱的歌 A SONG SUNG FOR EVERYONE
兩人齊聽的歌曲 A SONG FOR COUPLE'S EARS
獨自一人唱著的歌 SONG SUNG ALONE
憤怒 ANGER
窗戶外 OUTSIDE THE WINDOW
請你要小心 BE CAREFUL
離別 SEPARATION
淚 A TEAR
二葉 TWO-LEAF
我將脫胎換骨 BEING REBORN
C->R C->R
我也 ME TOO

江戸時代末期、「天人（あまんと）」と呼ばれる異星人達が襲来した。まもなく地球人と天人との間に十数年にも及ぶ攘夷戦争が勃発。数多くの侍、攘夷志士が天人との戦いに参加した。しかし、天人の絶大な力を見て弱腰になっていた幕府は、天人の侵略をあっさりと受け入れ開国してしまう。そして、幕府は天人による傀儡政権となり、天人たちが我が物顔で江戸の街を闊歩するようになった。一方、国や主君のために天人と戦った攘夷志士たちは弾圧の対象となり、他の侍たちもその多くが廃刀令により刀を失い、戦う気力を失っていた。
天人の襲来から20年後、剣術道場の跡取りで若輩ながら古風な侍気質を持つ志村新八は、剣術を生かす道もなく、意に沿わないアルバイトで生計をたてていた。そんな新八の前に風変わりな一人の侍が現れる。未だに変わらない侍魂をもった男、その名も坂田銀時。銀時の男気に惹かれた新八は、侍の魂を学ぶために彼の営業する万事屋で働きだす。やがて、万事屋には、戦闘種族である夜兎族の神楽や巨大犬の定春などが転がり込んでくる。
そして、万事屋ゆえに江戸のあらゆる依頼事（やっかいごと）に首を突っ込むようになった銀時たちは、江戸の治安を預かる真選組や、かつて銀時の盟友であった侍たちなど、様々な人間や天人たちと関わりあっていくことになる。