法證部的高級化驗師高彥博(歐陽震華飾)工作出色，備受讚許，遺憾是妻子古澤瑤(劉錦玲飾)，因為意外而癱瘓，但是，多年來他對妻子不離不棄，情深一片，贏得眾人，尤其是舅仔兼法醫科醫生古澤琛(林文龍飾)的佩服與讚譽，故而兩人感情要好。可惜瑤被診斷出患上癌症，禍不單行是她食過博送來的食物後竟突然死亡，令人懷疑博對妻子下毒手。尤其是警察部重案組的高級督察梁小柔(蒙嘉慧飾)，更懷疑博與丁沛沛(陳芷菁飾)舊情復熾，急不及待要解決瑤這個包袱。加上柔的弟弟梁小剛(鄭俊弘飾)是法證部的技術員，正是博的下屬，卻事事受他挑剔，但博對沛之妹妹林汀汀(鍾嘉欣飾)卻循循善誘，令柔覺得厚此薄彼，不滿博。

後來，柔的父親梁興隆(于洋飾)因為不甘被梁興忠所騙，與忠起爭執，事後忠被殺，隆在人證、物證確鑿下成為殺人疑犯。此時，博再以其客觀理智的態度，與琛鍥而不捨地反覆驗證，找出疑點，終揭發真兇。柔喜見父親沉冤得雪，對博大為感激，更對他博學而機智，不偏不倚的驗證態度信服，對他大為改觀。琛除了法醫工作之外，亦將自己的見聞創作出一系列推理小說，深受讀者歡迎，女友汀亦是其擁躉之一。未幾，在琛小說中出現的敗類竟相繼意外死亡，初時琛與博、柔以為純屬巧合，但漸漸覺得是有人模仿琛的小說進行地下裁判，濫用私刑，琛更因此而成為爭議對象，飽受壓力。汀為了替男友澄清，盡力追查兇手誰屬，但正當她找到線索時，卻突然受襲昏迷，生死未卜。琛大為緊張，柔決定設局引出真兇。一日，一個神秘人暗暗向博發出了戰書。一宗血案的兇手留下的指紋竟屬博，所有現場的不利證據矛頭均直指博，意味著整個法證部似是備受挑戰。

与世隔绝的海岛小渔村，忠厚善良的哑巴男孩阿水（古天乐饰）自小就没了父母，开了一个家庭旅馆兼杂货铺。阿水每天傍晚都会在面向大海的平台上打沙包，坐在木架边吹口琴。海风拂过，淡淡的生活节奏之于阿水简单而又幸福。假小子一般的女孩小四喜跟阿水很要好，几乎成了金水的翻译。然而这一切的平静生活，被一个从香港来到这个小岛度假的姑娘雯雯（蒙嘉慧饰）打破了。美丽温柔的雯雯住进了阿水家开的度假木屋里，渐渐地，她和阿水以及小四喜成为了好朋友，度过了非常愉快的几天。当雯雯就要离开的时候，阿水已经深深地爱上了她，可依旧没有勇气表白。 　　三年后，小四喜也离开了渔村，只有阿水一个人生活。阿水终于发现了那幅雯雯在墙上画给他的画。此刻，对雯雯万分思念的阿水终于决定去香港找她。然而意外发生了。

三名大陆赴港的毛贼在白天抢劫金铺后，遇上巡警慌张逃亡，其中一人逃入另一帮被警方通缉多时并配备有强大火力的大陆悍匪躲藏的大厦，紧接着，警方重案组的命运被这两帮歹徒意外牵连，当他们以为成功打死悍匪可以放松庆祝时，又碰上那两个漏网的毛贼，一轮混战后，事情顿时变得非常突然。
而与警匪交战主干线并行发展的爱情线来得也非常突然。重案组干将钟健（任达华）和李森（刘青云）在办金铺劫案时巧遇以前认识的茶餐厅老板，就她的芳心到底属谁，众人猜测一番后得到吃惊答案。