中世纪，炼金术士们以巨大的代价从恶魔的手中得到了传说中的永生之酒，凡是喝下永生之酒的人们，正如它的名字那样，将会得到永远不会死亡的肉体。永生之酒带来了希望，却也引发了空前绝后的灾难，因为私欲和利益，与此酒相关的人士一个接着一个失去了踪迹。随着禁酒令的颁布，永生之酒的下落逐渐成为了谜题，然而数年过后，有关它重出江湖的消息再次被传得沸沸扬扬，在纽约的黑道中激起了涟漪。
身怀绝技的少年洛菲（吉野裕行 配音）、不老不死的炼金术士阿洛瓦（宫本充 配音）、个性莽撞大大咧咧的夫妻艾萨克（小野坂昌也 配音）和哈文特（青木静香 配音），这些身份从无交集的人们，也为了追寻永生之酒的下落而走到了一起。

楠木赖子（高桥美佳子 配音）是个14岁的初中生，在班上没什么朋友，但偶然得到班上极为耀目的美少女柚木加菜子（戸松遥 配音）的青睐，两人成为朋友，不料相约乘电车去看湖时飞来横祸，加莱子落下站台被列车轧成重伤。刑警木场修太郎（关贵昭 配音）调查此案，发现加莱子似乎有着神秘的重要身 份，同时以多摩为中心，整片地区陆续发现许多被分尸的尸体残块，关注整个事件的中禅寺敦子（桑岛法子 配音）、关口巽（木内秀信 配音）、鸟口守彦（浪川大辅 配音）为了写出内幕报道，调查中在森林中发现古怪建筑物，如巨大的匣子，一切谜底的最终还要靠京极堂（平田広明 配音）揭开……