4年了，距离那场私人武装组织——天人与人类联盟军的决战过去4年了。
天人组织消失了，世界从3个巨大的国家联盟统一为一个联合政府，世界已经统一。但是，这只是表象。表面的政治统一，但军方秘密组织A-LAWS在暗中从事武装镇压，镇压所有反对联合政府的组织与团体。这样的世界，没有改变。人类依然没有从战争、纷争、矛盾之中解脱出来。天人组织再次回归！高达驾驶员刹那•F•清英驾驶新型号的机器人——高达00再次武力介入。这次，天人组织要面对的不仅是A-LAWS的机动战士部队，还有神秘组织变革者——其首领里冯兹正在计划一个更大的阴谋！
《机动战士高达00》系列动画片第2季。

UC.(宇宙世纪)0079年，人类已经在宇宙发展并建立了许多巨大的殖民卫星，让人类能够居住在宇宙中。位于SIDE3的吉翁公国不堪忍受地球联邦政府对其剥削和压迫，遂宣布独立并组建对地球联邦宣战。在战争中双方先后开发了机动战士并投入战场。NEWTYPE少年阿姆罗·雷无意中驾驶上联邦军新开发的RX-78-2高达，卷入后来被称为“一年战争”中，并与其宿敌夏亚·阿兹纳布尔相遇。故事即是以阿姆罗为中心，描述他跟着高达的母舰白色要塞，历经种种困难而成长的故事，还被认定为少见的“NewType”。不过第43话中阿姆罗能够跟怀特要塞中多位主要人物进行心灵感应，可以确定他们都是被阿姆罗引发起觉醒的NewType。
主角群并不是唯一参与这场世纪之战的人群，而且战斗也不限于主角所参与的战役，在后来的官方OVA和MSV等各种衍生作品中还有陆续补充的内容，并且收入官方的一年战争史中。本片的战斗并不见得完全是一般高达迷心中决定性的战役，或许更像主角群的心路历程和个人战斗记录。
本作品的主要故事是描写两个政治上对立组织的战争中，偶然但主动地成为军用机器人驾驶员的主角，以及他的同伴们，在战火中拼命求生的群像剧。不止主角方面，支援主角的人们以及与主角对立的吉恩公国军官士兵也有许多个性丰富的人物。本作品对于双方角色的细致描写使得作品的世界内容非常丰富，也产生了许多有思想深度的名场景与故事。
本作品中少年在地球与殖民地的战乱中，为阻止吉恩军对平民的无辜伤害，偶然中坐上联邦军的新锐的机动兵器“Mobile Suit”高达(高达) RX-78-2，跟着怀特要塞流转于地球与宇宙间的情节，也在日后许多续作中出现。包括《机动战士Z高达》中的卡缪·比丹，《机动战士高达 ZZ》中的捷多与《机动战士高达独角兽》中的巴纳吉。
之后还推出了三部剧场版动画《高达屹立在大地之上》，《哀战士》《相逢在宇宙》，此作无论人气，票房，收视都是高达系列中最高的。

宇宙移民与宇宙战争的历史—宇宙世纪终结后，时光飞逝，人们迎来新的历史Regild Century(R.C.)，并开始了繁荣与和平的生活。
RC1014年，耸立大地连接地球和宇宙的轨道天梯Capital Tower(首都塔)，从宇宙中为人类带来作为地球能量之源的Photon Battery，故被视为是圣地。
其守护组织Capital Guard候补生贝尔利·杰纳姆在初次飞行的时候遭到所属不明MS G-SELF的攻击。贝尔利使用维修检查用MS与其交战并成功捕获。
然而贝尔利对G-SELF的驾驶者，名为アイーダ・レイハントン的宇宙海贼少女产生了某种感觉。
不满足特定条件便不会启动的G-SELF对贝尔利产生了某种反应。
宇宙海贼和アイーダ的目的、被G-SELF选中的贝尔利的命运、令RC全体动摇的真相——这一切只不过是Reconguista的开始。

以主人公安久为轴，描写战斗少女们的群像剧。故事讲述了掌握了高端情报技术“玛娜”的人类，借助它的力量克服了地球上的战争、饥饿、污染等问题，终于迎来了和平的理想乡。然而，作为皇国第一皇女的安久丽莎，却因无法使用这等魔法之力而沦为士兵，并被派遣到偏僻的岛屿上，同其他少女们操纵变形人型兵器“帕拉美露”，共同对抗入侵而至的巨大攻击型生物——龙。于是，少女的不屈物语就此开始了……

After the Dawn Rebellion, Char travels to Earth and meets a girl with mysterious powers named Lalah Sune.
Meanwhile, Amuro's father Tem Ray is working on the RX-78 development project. Learning of the defection of Doctor Minovsky, a key figure in Zeon mobile suit development, he heads for the moon. History's first battle between mobile suits unfolds in the twilight zone of the lunar surface.
Then comes Universal Century 0079. Side 3, the space city furthest from the Earth, launches a war of independence against the Earth Federation government under the name of the Principality of Zeon.
An era of violent upheaval begins, in which half of the total human population will be killed...

自第二次新吉翁战争结束了12年后的U.C.105年，因地球联邦政府的腐败和地球环境污染的加速，在强制平民前往宇宙的同时，也开始实施非人道的政策“人类狩猎”。
在这种局面下，反地球联邦政府运动组织“马夫蒂”，在组织首领：“马夫蒂·纳比尤·艾林”（其真实身份是联邦军内素有声望的一年战争的功臣联邦军上校布莱德·诺亚之子哈萨维·诺亚）的带领下，针对地球联邦高官展开了暗杀等一系列恐怖活动。
继承了阿姆罗·雷和夏亚·阿兹纳布尔两人的思想，成为了为了内心的意志和道路而不断奋斗前行的战士哈萨维，却与联邦军上校凯奈斯·斯雷克和谜之少女琪琪·安达露西亚相遇了，而这也是改变他们命运的相遇。