成为“第三次冲击”元凶的碇真嗣，变得像废人一样……真嗣还能振作起来吗？2012年《福音战士新剧场版：Q》之后，这部动画讲述了被封印的故事的后续。

彼の国には龍が棲んでいる──
神話によれば、古の人々との契約により、龍は人を助け、人は龍を助けるという…
舞台は “龍の国”。
主人公は、国の守護神 “龍”を虫歯菌から守る新米・歯医者の野ノ子。
隣国との戦争が激化する中、ある日彼女は、龍の歯の上で気絶した敵国の少年兵を見つける。
少年の名はベル。
大きな災いの前に龍が起こすと言われる不思議な現象で、巨大な歯の中から生き返ったものだった。
自らが置かれた状況に戸惑うベル。そして彼を励まし、彼を龍の歯医者として受け入れる野ノ子。
激しい戦いに巻き込まれながら、二人はやがて自らの運命を受け入れて行くことに…
かつてない壮大なスケールで描かれる冒険ファンタジー！

自从大学毕业后，“我”（林原惠美 配音）独自一人在东京打拼。一向行为怪异的弟弟，某天做出了一个奇怪的预言，他说东京在第二天即将毁灭。这样的话有谁会相信呢？可是，诡异的事情就是如此悄然发生。喧嚣的东京街头，不知来自何处的火星纷纷聚集，盘桓在楼宇之间，城市的上空。俄而巨神兵巨大的身形出现在人们的头顶。他手执火一般的长矛，嘴里伸出炮筒，瞬间摧毁了眼前的街道。弟弟的预言成真了？对于这座城市乃至世界而言，这是人类的末日？还是新时代的开始？
本片为庵野秀明和樋口真嗣采用昭和、平成时代的特摄技法拍摄的特摄短片，巨神兵形象来自宫崎骏的《风之谷》。短片最初在“馆长 庵野秀明特摄博物馆”的展览上播放，之后作为贴片随《EVA 新剧场版：Q》一同上映。

14年前，初号机疑似神化第一形态的觉醒带来近三冲击，使世界发生前所未有的巨变。在此之后，葛城美里（三石琴乃 配音）等NERV旧部出走，成立了反抗seele和NERV的Wille。Wille授命明日香（宫村优子 配音）和真里（坂本真绫 配音）夺回被封印在卫星轨道上的初号机和碇真嗣（绪方惠美 配音），但绝对禁止真嗣登上初号机。感受到周遭的敌意，懵懂的真嗣跟随绫波丽（林原惠美 配音）登上突然入侵的九号机，返回了千疮百孔的NERV总部。在这里，他意外重逢朝思夜想的绫波，还从父亲那里得知自己将和美少年渚薰（石田彰 配音）共同驾驶十三号机。长达14年的空白，期间的沧桑巨变和情感纠葛让真嗣不知所措。而看似温柔的渚薰为他揭开了种种难以置信的真相……
本片为EVA新剧场版四部曲的第三部。