1939年，国际局势动荡不安。由于在中国战场上受到由美国支持的国军的牵制，日本国内上下掀起阵阵反美热潮，自陆军到普通民众，无不呼吁本国与德、意缔结三国同盟，向美利坚开展。而在这股近乎癫狂的呼声背后，只有少数人能冷静认清国际局势，这其中便包括海军大臣米内光政（柄本明 饰）、海军次官山本五十六（役所広司 饰）等人。可是他们的声音被有意无意忽视，高层最终决定对美开展，而在此命运关隘，山本五十六则被任命为联合舰队司令长官。明知不可为而为之，山本策划了震惊世界并永载战争史册的珍珠港事件。一旦投入战争，抽身而退便已不是一件容易的事情。
山本五十六在人生的最后时光里，见证着祖国最为惨痛的历史……

1941年，太平洋战争爆发，日本海军偷袭珍珠港成功，继而在战争初期，一度掌握了太平洋战场的主动权，为了打开美军的石油封锁线，日本进攻太平洋上的美军大型基地中途岛，此次由于情报失误，日本海军损失惨重，并从此在太平洋战场走下坡路，从而导致在这场战争中最终失败的命运。

这是一部真实的电影，真实展现了日军偷袭珍珠港的历史。美军插手太平洋战场，日军最高将领山本五十六（山村聪 Sô Yamamura 饰）认为美军实力强大，应速战速战，不宜和美国人打长久战。于是，由他一手策划的偷袭珍珠港行动正式启动了。
虽然美军从此前截获的日军密电中得知了日军可能进行突袭的消息，但多数人都对此不屑一顾，密电的内容也没进行上报。即使在突袭当天美军一个士兵发现了雷达上不寻常的飞机群，美军将领仍然认为那是自己的飞机在执行巡逻任务。最终使得日军偷袭行动一举成功，美军损失惨重。山本五十六也成了美国人最大的眼中钉。

昭和十五年。考古学者本郷直樹は次男の真二が自分と同じく学問の道を志すことを喜んでいた。兄の英一は父の意に反して海軍少尉になっていた。一方、船大工の小田切武市は一人息子の正人が海軍兵学校に合格したので有頂点になっていた。十八年間海軍に勤めても下士官止りの武市は正人の将来は約束されたと信じて疑わなかった。一年が過ぎた。世界情勢は日毎に緊迫の色を強め、戦争の予感は現実のものになろうとしていた。昭和十六年十二月八日、早期和平を強調する山本五十六のもとで、連合艦隊は、ハワイ真珠湾に奇襲をかけた。次々と炎上する米海軍の戦艦群を、英一は興奮の面持ちで見つめていた。その頃、五年の歳月と建艦技術の粋を集めた空前総後の巨艦、大和が完成した。山本はアメリカに時間を与えず、早期和平に持ち込もうと、ミッドウェイ作戦に賭けた。しかし、作戦は失敗に終り、戦局は消耗戦へと展開していった。数々の戦闘を体験している英一は、死を覚悟し、婚約者の陽子と式を挙げたが、指一本触れずに戦場へもどった。やがて大学生の真二も召集され兵学校を卒業した正人も武市の意に反して零戦に乗る決意をしていた。日本軍は劣勢に回り、起死回生のレイテ作戦に出た。英一は戦場で真二と出会った。陽子への仕打ちをなじる真二に「陽子を頼む」と遺書を残して英一は大空に散った。英一の残したライフ・ジャケットのために沈む船から脱出した真二は、生きる喜びをあらためて知り、陽子と生きようと陸上勤務を志願するが、大和への転属を命ぜられる。死を目前にして真二は陽子を抱けなかった兄の気持を初めて理解した。陽子は逆だった。愛する人に抱かれたい。陽子は真二に激しく体をぶつけるのだった。同じ頃、正人は特攻を志願していた。武市は息子の出世に固執し兵学校へ行かせた己の浅薄さを呪い戦争の恐しさを痛感した。戦況は挽回の余地もない所まで来ていた。そしてついに、最後の切札、大和の沖縄への水上特攻が計画されるに至った。大和は出撃した。真二も正人もその中にいた。そして、陽子、武市、多くの肉親を残して、大和艦上の戦士たちはその命を沈めていった。

1945年2月，被喻为“太平洋的绞肉机”的硫磺岛战争结束。在战斗的第五天时，五名美军海军士兵、一名军医、一名随军记者一起“缔造”了一张英雄的照片，一张象征国家胜利的照片：他们将美国国旗插在了硫磺岛的制高点。当照片登上美国各大报纸头条的时候，当时的六名英雄中的三人甚至还不及知道自己成为英雄就英勇牺牲了。幸存下来的其余三人战后却对那场战争只字不提，仿佛他们未曾参与那场战争。
因为他们不是为了成为英雄才走上战场，当他们看到身边的伙伴一个个倒下时，他们觉得生命的意义也在一点点流失……

中途岛战役失利直接宣布了日军在太平洋战场上的失败，负隅顽抗的日军依然坚守日本最南端的小岛—硫磺岛。这个看似不起眼的小岛，却上演了二战太平洋上最惨烈的战争。
栗林忠道中将（渡边谦 饰）是日军在硫磺岛的指挥官，负责这道日军最后的防线。栗林中将大力改革日军内部的陋习和不足，并设计出一整套对付美军、以拖延为主的作战方案。虽然他和日军的二万名官兵都上下齐心，但面对占尽空中优势的四万名美军士兵，栗林知道这将是一场没有归路的战争。
在最后的战争之前，栗林写下了他最后的家书……