2009年，当麻纱绫（户田惠梨香 饰）和濑文焚流（加濑亮 饰）相识的前一年。在美国FBI学成归来的当麻被分在警视厅公安部公安第五课未详事件特别对策系，接受组长野野村光太郎的直接领导。此前不久，某大型石油企业高管接连被人杀害，死者的心脏无一例外都留下被人用手捏过的痕迹。显而易见，这一系列事件和所谓的SPEC持有者有着极为密切的联系。与此同时，石油企业高管Diablo（大杉涟 饰）高薪聘请神秘SPEC持有者一十一（神木隆之介 饰），企图阻挡神秘的SPEC杀手。一十一，这个日后与当麻和濑文有着不解渊源的难缠敌手将当麻视作杀害父母的爆弹女，之后更斩杀了当麻在美国结识的好友Nancy。
SPEC宏大篇章自此拉开序幕，决定世界命运的重大事件也进入了倒计时……

掌控日本国家未来的御前会议上，众要员商议着以猎杀SPEC持有者为目标的“SIMPLE PLAN”，神秘的法蒂玛第三预言亦被提及。数天后，暗中执行猎杀计划的政府成员突然于游艇上全员木乃伊化死亡。案件交由未详系的当麻纱绫（户田惠梨香 饰）和濑文焚流（加濑亮 饰）负责。调查途中两人接到志村美玲（福田沙纪 饰）的求救电话，赶赴救援时与濑文的前同僚兼前恋人青池里子（栗山千明 饰）不期而遇。当麻将美玲带回未详系，原本已经死去的阳太/一十一（神木隆之介 饰）竟从容现身于她们面前。竭力压制着蠢蠢欲动的左手，当麻无力的目睹美玲匆忙留下“一定要阻止法蒂玛第三预言”的信息后被阳太带走。
在阳太的恶意煽动下，普通人类与SPEC持有者间的矛盾日益激化。身处两者夹缝之中，当麻对法蒂玛第三预言和人类未来的走向充满了迷惑。玛利亚、白衣教皇、左手持火之剑的天使……预言中的关键人物们若隐若现，黑暗降临的未来是否终将无法避免？

经验尚浅的小律师青砥纯子（户田惠梨香 饰）应聘上了大型律师事务所名律师芹泽豪（佐藤浩市 饰）的助理。就职第一天，既忐忑又兴奋的纯子被交代了去和大型商贸公司的社长会面，并被告知要顺着对方的意思。纯子在迷糊中答应了社长的私人请求，即帮忙调查新日本葬礼社社长的密室死亡案件。
而芹泽这边，因为纯子的原因意外被关进了银行的金库里，在大家都焦头烂额的情况下，来自保安公司的榎本径（大野智 饰）完成了不可能的任务，以高超的技术开启了金库的大门。好奇心爆棚的纯子因此拜托对密室有兴趣的榎本参与解决这桩密室死亡事件。
于是芹泽、纯子和榎本组成了密室案三人组，接二连三阴差阳错地解决了各类密室杀人案，上锁的房间一一被开启。沉默寡言一心研究撬门溜锁的榎本也在一系列的案件中得到了芹泽和纯子的信任和喜爱，而榎本的背后似乎掩埋着什么不可告人的秘密？

柏木修二（三浦春马 饰）即将赴任明稜学院高等学校的生物老师。作为老师的他真挚对待学生，也十分受学生家长信赖，与同在一所高校的未婚妻上村夏实（户田惠梨香 饰）半年后就要结婚，外人看来无论工作生活都是处在幸福当中。但就在赴任的那一天早上，宿醉的他醒来发现床上居然躺着一个浑身赤裸的年轻女孩，无比鄂然的柏木对头天晚上所发生的事情却怎么也想不起来,无奈之下他只能把家里的大门钥匙留下给女孩。更要命的是，这个女孩居然是自己即将负责的班级里的一名女学生——佐伯光（武井咲 饰）。柏木负责的班级里所发生了学生早恋事件，做为负责人的柏木在与学生们的一番推心置腹的讲话中却使得佐伯光心有所思，而此时，夏实也发现柏木这名神秘的女学生之间的关系似乎并不简单。修二不断承受着背叛了未婚妻的痛苦，一边又准备拯救内心有阴影的学生。在爱与背叛之间，每个人都开始思考什么才是真正的爱……

所谓Liar Game，是由一个名为“LGT事务所”的神秘组织举办的比赛，规则是让选手们通过相互欺骗来争夺奖金。
单纯的大学生神崎直（戸田恵梨香饰）在两年前也不慎卷入这个可怕的游戏，当时她在天才诈欺师秋山深一（松田翔太饰）的帮助下，才好不容易退出比赛，恢复了平静的生活。
没想到Liar Game战火又起，为了帮助更多无辜的人，小直屹然挺身而出，而秋山为了彻底摧毁LGT事务所也重返战场，他们意外地和曾经的敌人福永（铃木浩介饰）相遇并被编为一队，这一次，他们将要迎来的会是怎样的游戏和对手？

1993年，以“林氏盖饭”做招牌菜的饭店里有着幸福的一家，这晚三个孩子偷偷出去看流星躲过了灭门的惨案，当他们回来时发现父母已被刺杀身亡。
到了2008年，大哥有明功一（二宫和也 Kazunari Ninomiya 饰）在一家料理店打工，却不肯为客人再做一次家传的“林氏盖饭”；二弟泰辅（锦户亮 Ryo Nishikido 饰）和妹妹静奈（户田惠梨香 Erika Toda 饰）在东京共租一个房间。三人的生活都有点吊儿郎当，是当年惨案以及相依为命成长的童年的后遗症。眼看到11月就会过了案件诉讼期了，他们三兄妹立誓一定要把当年杀害父母的凶手抓出来。
他们没想到，最大的误算来自于妹妹的恋爱。