东京湾水隧轰然巨响、大水灌入，突发原因不明的崩塌事件。首相官邸召集阁僚开紧急会议，大多认为“原因是地震、海底火山”，看过网络目击影片的内阁官房副长官矢口兰堂（长谷川博己）指出海中可能栖息巨大生物，内阁总理大臣辅佐官赤坂秀树（竹野内丰）及周围的人对矢口意见皆付之一笑。其后，在海上巨大不明生物现身，惊慌失措的政府相关人员收集情报追踪之际，巨大生物登陆镰仓沿路破坏建物前进，日本政府因应设置紧急对策本部下达防卫出动命令，美国国务院则派遣总统特使加代子·安·派特森（石原聪美）关切，面临未曾有的威胁，不仅日本、世界也注视其动向。自卫队与称作“哥斯拉”的巨大生物在川崎市展开大决战，究竟人类是否抵御得了这远远超出所知的“完全生物”。

自从大学毕业后，“我”（林原惠美 配音）独自一人在东京打拼。一向行为怪异的弟弟，某天做出了一个奇怪的预言，他说东京在第二天即将毁灭。这样的话有谁会相信呢？可是，诡异的事情就是如此悄然发生。喧嚣的东京街头，不知来自何处的火星纷纷聚集，盘桓在楼宇之间，城市的上空。俄而巨神兵巨大的身形出现在人们的头顶。他手执火一般的长矛，嘴里伸出炮筒，瞬间摧毁了眼前的街道。弟弟的预言成真了？对于这座城市乃至世界而言，这是人类的末日？还是新时代的开始？
本片为庵野秀明和樋口真嗣采用昭和、平成时代的特摄技法拍摄的特摄短片，巨神兵形象来自宫崎骏的《风之谷》。短片最初在“馆长 庵野秀明特摄博物馆”的展览上播放，之后作为贴片随《EVA 新剧场版：Q》一同上映。