故事发生在《终结者2》10年之后，终结者又回来了。
此时John Connor(Nick Stahl) 饰)已经22岁，他的母亲去世后，他过着隐姓埋名的生活，不愿意面对即将到来的命运。但是，命运并不以他的意志为转移，“天网”经历了两个失败之后，派出了更为先进的T-X终结者（Kristanna Loken 饰）来追杀他，人类也同样送回了T-800改良后的终结者T-850（Arnold Schwarzenegger饰）保护John。
John巧遇了儿时的伙伴，兽医Kate Brewster（Claire Danes 饰)，Kate的父亲是美国军方“天网”系统的负责人，她本人也将成为人类叛军的副统领，理所当然成了T-X的打击对象。二人在T-850的保护下，开始了逃亡之路。
同时，美国电脑系统病毒入侵，人类束手无策之下准备启用“天网”，一旦“天网”接管美国军方防御系统，人类将首当其冲的被消灭。
面对已经发生的未来，John Connor和Kate Brewster决定奋起反抗，在T-850的帮助下，他们将又一次改变人类的命运。

故事发生在遥远的2095年，天空中出现了神秘的金字塔，金字塔中所禁锢的，正是鹰头人身的太阳神荷若丝（Thomas M. Pollard 饰），为了延长自己的寿命和法力，荷若丝逃出了重重禁锢，决定在凡间找一对男女生育自己的后代，被冰冻的太空人尼科波尔（托马斯·克莱舒曼 Thomas Kretschmann 饰）不幸成为了他的目标，最终，荷若丝成功的附在了尼科波尔的身体里。
吉尔（Barbara Scaff 饰）拥有着能够流出蓝色泪水的特异功能，对于自己的与众不同，吉尔感到十分困惑和无奈，更糟糕的是，天赋异禀的吉尔沦为了大型医药企业的人体试验对象，这样一位可怜的女子，成为了荷若丝的目标，命运的齿轮就此开始转动。

导演率领拍摄组来到神秘的骷髅岛开始了一部电影的拍摄，女主角是漂亮娇小的安(娜奥米•沃茨 Naomi Watts 饰)，她在纽约的演艺事业陷入了低谷，这是她时来运转的大好机会。他们乘坐轮船来到岛上，却不知在岛上即将要险象横生。
正当导演要开始开机拍摄时，他们遭到了当地土著的袭击，几个随行人员遇难身亡。摄制组慌忙逃离，幸好起航离去，却发现不见了女主角安。
原来安土著野人抓走，被当作祭品。安尖声惊叫，引来了传说中骷髅岛的猩猩——金刚的关注。金刚在岛上很有霸气，连恐龙都要忌它几分。然而，野兽爱上了美人，金刚搭救安脱离困境，不料却让自己陷入了一场悲剧。