平静的一天，警局却突然出现了大骚动。原来古畑任三郎（田村正和 饰）下落不明，引来各方恐慌与猜测。据古畑刑警的好搭档今泉慎太郎（西村雅彦 饰）的描述，古畑在解决完二叶凤翠（山口智子 饰）的案件后（SP しばしのお別れ），只身前往别庄，也就是漫画家小石川千波（中森明菜 饰）的别墅（第一回 死者からの伝言），从此便消失无踪。为了查明真相，警方调查了小石川千奈美、中村右近（堺正章 饰）、黑田清（石黒賢 饰）等所有古畑抓获过的犯人，他们有的对古畑感恩有加，有的对其愤恨不已，然而却始终找不到丝毫有用的线索。最终的结果却令人捏了一把汗……
本片为1996年上映的总集篇。

一头卷曲长发、永远的黑色西装，举止优雅，态度谦和，可是温柔笑容背后却是令所有罪恶都无处遁形的敏锐观察力，这便是拥有高超推理能力的绅士刑警古畑任三郎（田村正和 饰）。新一季中，患有自律神经失调症而长期休养的今泉慎太郎（西村雅彦 饰）陷入热恋，可是却意外成为一起杀人案的嫌疑人。这起案件之后，古畑和今泉这对黄金搭档再次合作，迎接一个又一个难缠对手的挑战，杀害同事的女校教师宇佐美百合江（泽口靖子 饰）、自导自演摩天轮爆炸案的林功夫（木村拓哉 饰）、电视智力挑战赛常胜冠军千堂谦吉（唐泽寿明 饰）、赴美旅途中所偶遇的神秘美女（鈴木保奈美 饰）……
无论多么完美的犯罪，都会留下蛛丝马迹，而古畑刑警正是这些线索的发现者！

一个大雨之夜，在金泽市第三码头有一辆汽车没有刹车直接冲进了大海里，白川球磨子（沢口靖子 饰）由于会游泳而摆脱是死神游上岸来，不会游泳的丈夫、金泽料理店金城楼的老板福太郎（小林稔侍 饰）随车一起葬身大海。由于北陆日日新闻记者容子（室井滋 饰）撰写一连串负面报道，更称球磨子为“鬼磨球”，留给大众以及警察恶劣的印象，更因为这些报道，让警察在没有十足证据的情况下逮捕了球磨子。
律师原山（津川雅彦 饰）找来朋友律师佐原（田村正和 饰）共同研究这个案子，佐原拒绝了。一审判决后球磨子被判死刑，她写了一封诚恳的信向佐原求助，这封信与球磨子一向咄咄逼人的态度有所不同，打动佐原成为她的辩护律师。自此佐原开始调查球磨子的一生，以及与丈夫福太郎的关系，为她翻案……