撒旦假扮外国教授沃兰德走访二十世纪三十年代的苏联首都莫斯科，遇见莫斯科文联主席柏辽兹和青年诗人伊凡，他们不信上帝，也不信魔鬼，沃兰德逐一反驳，并预言柏辽兹当天的死亡。伊凡目睹柏辽兹被电车辗毙的惨剧，怀疑沃兰德是外国特务，紧追不舍，却被关入精神病院，并认识了大师。大师是个不知名的作家，情人玛格丽特崇拜他的才华，称他为大师，他也就以此自居。
大师写过一本关于彼拉多审判耶稣的小说，受到批判后，惊恐之下烧毁了手稿，进了精神病院。大师失踪后，玛格丽特到处寻找，遇见撒旦的随从，得到回春脂，恢复青春，经历许多奇事后，终于救出大师。在撒旦的指引下，大师和玛格丽特的灵魂越过莫斯科的麻雀山，飞向永恒的家园。
《大师和玛格丽特》把历史传奇、神秘幻想和现实生活糅合起来，被认为是二十世纪魔幻现实主义的代表作之一。

《大师和玛格丽特》究竟是怎样一部书？它是一本“对二三十年代苏联社会现实进行恶意嘲讽”、“主张向恶势力投降并为它服务”的怪诞小说呢？抑或是“启迪人们内心的善，净化人的心灵”、“帮助人们牢牢把握住自己内心的道德准绳”、歌颂“人对真善美的大胆追求的”“当代苏联文学中的一部主要杰作”呢？众说纷纭。本书作者布尔加科夫又究竟是一个“不理解无产阶级十月革命”、“暴露了本身的人道主义弱点”的平庸作家呢？还是一位思想深邃、“以大无畏精神向一切恶提出挑战”、“集讽刺作家、幻想题材作家、现实主义作家的天才于一身”的文学大师呢？他为何曾把花费两年心血写到第十五章的这部作品的原稿付之一炬，后来又重新握笔，前后历时十二载，八易其稿呢？他在自知身患绝症、不久人世的情况下，在生活困苦、精神压力沉重、明知这部作品不可能发表的处境中，是什么力量支持他坚持修改并补充它，直至生命之烛燃尽呢？现在看来，至少可以说：盖棺时某些人论定他为“反政治的小说家和不严肃的幽默家”，把他的作品说成是“存心取悦于读者”、“恶意讽刺现实”等，这些结论是下得过于仓促了。为布尔加科夫恢复名誉成为苏联文艺界一桩重要事件，他的作品在八十年代仍如此畅销，这里必定有其内在原因。我们应该努力通过作者的思想、生活及创作道路探索他的创作意图，在作品本身中寻找其艺术魅力的源泉及上述问题的答案。